ilmastovaikutukset
Alligaattorikilpikonnien elinympäristö Floridassa on tällä hetkellä suuressa vaarassa ihmisen kehityksen vuoksi alueella, mikä todennäköisesti pahenee ilmastonmuutoksen myötä. Ihmisen toiminnasta johtuva sedimentaatio tai ilmastonmuutoksen voimistamat voimakkaat sadetapahtumat voivat tuoda veteen monia pienhiukkasia, jotka aiheuttavat liettymistä ja vähentävää fotosynteesiä vesikasveissa. Ilmastonmuutoksesta johtuvat muuttuvat sääolosuhteet sekä äärimmäiset lämpötilat voivat vaikuttaa haitallisesti lajin soveltuvuuteen ja lisääntymismenestykseen. Veden laadun muutokset, jotka johtuvat merenpinnan nousun aiheuttamasta saastumisesta ja suolaisen veden tunkeutumisesta, voivat myös aiheuttaa elinympäristöjen heikkenemistä ja ihmishenkien menetyksiä. Monien matelijoiden tavoin alligaattorikilpikonnien sukupuoli riippuu lämpötilasta ja alkioista tulee naaraita, kun haudontalämpötila nousee yli 84 asteen. Ajan myötä huomattavasti lämpimämmät lämpötilat voivat johtaa epätasapainoisiin sukupuolisuhteisiin lajissa.
lisätietoja yleisistä ilmastovaikutuksista lajeille Floridassa.